Ti mimiti pandémik, tés diagnostik parantos maénkeun peran penting dina ngadalikeun panyebaran SARS-CoV-2, virus anu nyababkeun.COVID 19.Tes antigén gancangdipigawé di imah atawa dina setting klinis nyadiakeun hasil dina 15 menit atawa kirang.Sateuacanna jalma didiagnosis, langkung gancang aranjeunna tiasa milarian perhatian médis sareng ngasingkeun diri ti batur.Tapi nalika varian anyar virus muncul, varian éta moal tiasa dideteksi ku tés ieu.
Kaseueuran tés antigén gancang dirancang pikeun ngadeteksi protéin nukléokapsid SARS-CoV-2 atanapi N-protein.Protéin ieu kapanggih dina kaayaanana dina partikel virus jeung jalma kainféksi.Kit tés gancangs biasana ngandung dua antibodi diagnostik béda nu ngabeungkeut bagian béda tina protéin N.Nalika hiji antibodi ngiket kana protéin N dina sampel, garis berwarna atawa sinyal lianna nembongan dina kit test, nunjukkeun hiji inféksi.
Protéin N diwangun ku 419 unit struktural asam amino.Salah sahijina tiasa diganti ku asam amino sanés ku mutasi.Grup panalungtikan dipingpin ku Ph.D.Philip Frank sareng Eric Ortlund ti Universitas Emory badé nalungtik kumaha parobahan asam amino tunggal ieu mangaruhan kinerja tés antigén gancang.Aranjeunna nganggo téknik anu disebut scanning mutasi jero pikeun sakaligus ngira-ngira kumaha unggal mutasi dina protéin N virus mangaruhan ngabeungkeut antibodi diagnostik.Hasilna diterbitkeun dina Sél dina Séptémber 15, 2022.
Panaliti nyiptakeun perpustakaan komprehensif ngeunaan mutasi protéin ampir 8,000 N.Varian ieu nyababkeun langkung ti 99,5% tina sadaya mutasi anu mungkin.Aranjeunna teras ngevaluasi kumaha unggal varian berinteraksi sareng 17 antibodi diagnostik anu béda anu dianggo dina 11 tés antigén gancang anu sayogi komersil, kalebet umum.kit imah.
Tim ditaksir mana mutasi N-protéin mangaruhan pangakuan antibodi.Dumasar inpormasi ieu, aranjeunna nyiptakeun "profil mutasi ngewa" pikeun unggal antibodi diagnostik.Profil ieu ngaidentipikasi mutasi khusus dina protéin N anu tiasa mangaruhan kamampuan antibodi pikeun ngabeungkeut targetna.Analisis nunjukkeun yén antibodi anu dianggo dina tés gancang ayeuna ngakuan sareng ngabeungkeut sadaya varian jaman baheula sareng ayeuna SARS-CoV-2 anu prihatin sareng prihatin.
Sanajan sababaraha antibodi diagnostik ngakuan wewengkon sarua protéin N, peneliti manggihan yén unggal antibodi boga signature unik tina mutasi kabur.Nalika virus SARS-CoV-2 terus mutasi sareng ngahasilkeun varian anyar, data ieu tiasa dianggo pikeun nandaan antibodi kit uji anu kedah ditaksir deui.
"Idéntifikasi anu akurat sareng éfisién pikeun jalma anu katépaan tetep janten strategi kritis pikeun mitigasi COVID-19, sareng panilitian kami nyayogikeun inpormasi ngeunaan mutasi SARS-CoV-2 anu bakal datang anu tiasa ngaganggu deteksi," saur Ortlund."Hasil anu digariskeun di dieu ngamungkinkeun urang gancang adaptasi kana virus ieu kusabab varian anyar terus muncul, nunjukkeun implikasi kaséhatan klinis sareng masarakat langsung."
Latar: Mutasi Deep Scan ngadeteksi mutasi kabur dina nukléokapsid SARS-CoV-2 nganggo tés antigén gancang anu sayogi ayeuna.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, sél Ortlund EA.2022 Séptémber 15;185(19):3603-3616.e13.Kamentrian Dalam Negeri: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 Agustus 2022 PMID: 36084631.
Waragad: National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering NIH (NIBIB), National Institute of Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) and National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters mangrupikeun pembaruan mingguan tina hasil panilitian konci NIH anu diulas ku para ahli NIH.Diterbitkeun ku Kantor Komunikasi sareng Urusan Umum Diréktur National Institutes of Health.